今回不正使用が明らかになったのは、以前職務乗車証は本人の写真と社印と割印があるもので、改札口で駅員やバスの運転手に見せることで使用していたので、証拠は残らなかったのです。しかし市営や一部の私鉄では写真のないただの職務乗車証と書いてある定期券と同じ磁気カードなんで、使用した履歴が機械に残っているので証拠が成立したわけです。
私鉄の場合、職務以外で使おうと責める人は誰もでてこないと思います。

横浜市交通局の職員は私鉄の使用したものは、たとえ不正使用としても、私鉄からは苦情はこないと思います。

当たり前の暗黙の了解で続いてきたものだからです。