世界各国の軍には、必ずと言って良いほど、特殊部隊が存在します。
以下、いくつか例を挙げると

アメリカ　陸軍…グリーンベレー、デルタフォース
　　　　　 海軍…シールズ
　　　　　 空軍…ナイトストーカーズ
　　　　 　海兵隊…リーコン

イギリス　陸軍…ＳＡＳ
　　　　　　海軍…ＳＢＳ

ドイツ　陸軍…ＫＳＫ

日本　陸上自衛隊…特殊作戦群（ＳＯＧ）
　　　　海上自衛隊…特別警備隊（ＳＢＵ）
　　　　航空自衛隊…基地防衛教導隊（現在、編成準備中。平成２０年に発足予定）

などが挙げられます。
担当任務は各部隊により異なりますが、警察系特殊部隊と異なるのは、戦場における不正規戦（対ゲリラ、コマンド戦）を想定している点です。テロリストは「敵」と見なし、基本的に相手を殲滅するまで戦い続けます。人質がいれば、救出に対する配慮はしますが、テロリストの殲滅を優先することが多いです。

また隊員は「法の執行者」ではなく「兵士」ですので、武器使用時の法的な制約は、基本的にありません。ただし、自衛隊が「治安出動」した場合は別で、武器の使用は「警察官職務執行法第７条」に基づかなくてはなりません。

これらの部隊の長所は、戦闘（制圧）能力において、警察系特殊部隊を大きく上回る点です。

また短所としては、国内のテロ事件等に出動する際、政治指導者（大統領や首相など）の決断が必要になる点です。軍事系特殊部隊は、警察系特殊部隊ほど容易には、国内で発生した事態に出動できない傾向があります。治安組織が充実している先進国には、この傾向が強いようです。