H-2さん、返信が遅れてしまいすみません。
質問した後、和歌山、山梨に配備していることがわかりました。
ソースは、柿谷哲也･菊地雅之共著｢最新 日本の対テロ特殊部隊｣です。
和歌山
P50に写真あり。

山梨
P59に写真あり。

また、ウキペディアの銃対の欄に2002年にMP5が配備された理由は、原発と在日米軍施設などの警備のためだそうです。そこで、調べました。
原発(2002年)
北海道、宮城、福島、新潟、茨城、静岡、石川、福井、島根、愛媛、佐賀、鹿児島

在日米軍施設(専門)←ソースは、防衛省のHP

北海道、青森、埼玉、東京、神奈川、千葉、静岡、広島、山口、福岡、佐賀、長崎、沖縄

これらの施設がある22都道府県にMP5が配備しているのは確実のようです。
しかし、原発や米軍施設がない府県にも配備されているので、これからも広がっていくようです。
長文、失礼致しました(T_T)