こんにちは。

＞SATとSPの格闘能力ではSATの方が上回るでしょうか？

SP（警護担当警察官）は警護対象者が襲撃を受けた場合、速やかに避難させて安全を確保することが任務であり、犯人の制圧や逮捕は二次的な任務です。
一方、SATはテロリストや凶悪犯罪者の制圧を担当しています。
ですから格闘技を使用して凶悪犯やテロリストを制圧する能力は、SATの方が上だと思います。

＞SATの射撃を見ていると犯人の眉間に命中させていますが、SSTも射撃するとなれば眉間に命中させるのでしょうか

SSTはSATのように射撃訓練を公開していないため、詳細は不明ですが、船内で射撃をする場合、跳弾も計算しなければなりません。
個人的な推測ですが、頭部だけを狙って撃つと、跳弾により人質やSST隊員に危険が及ぶ可能性があるため、状況に応じて胴体なども狙って射撃するのではないかと思います。