転写の三角錐（３）主役はRNAポリメラーゼ
＜四次元能版EVA：モナドックスロジー：PS三角錐の応用＞

転写の三角錐（２）ＲＮＡの作られ方
http://www.beach.jp/circleboard/ad00178/topic/1100200053728

の続きです。

ＲＮＡの作られ方（RNApair)
http://www.mls.sci.hiroshima-u.ac.jp/smg/education/transcription.html

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RNAには伝令RNA（mRNA）・運搬RNA（tRNA）・リボソーム RNA（rRNA）があるということで、突然３種類のRNAがでてきましたので戸惑いますが、007のスパイ・アクションドラマと対比させて見ましょう。このドラマは細胞の中に忍び込んでではなく内部に共犯者を作りDNAのコピーを持ってこさせるというのが筋書きです。

転写三角錐（ドラマ仕立て）

＜荒筋＞

ＤNA情報を持ってくる：核→→→→リボゾーム（タンパク質の生成工場）

＜極秘情報の運び屋の登場＞

RNAポリメラーゼ（転写）：DNA（極秘情報）→→→mRNA（極秘情報の運び屋）

＜アミノ酸の運搬屋の登場＞

RNAポリメラーゼ（転写）：DNA→→→tRNA（運搬屋）

＜リボゾームの構築屋の登場＞

RNAポリメラーゼ（転写）：DNA→→→rRNA（（リボゾーム構築屋）

＜００７の共犯者の登場＞

mRNA（タンパク質の生成）：リボゾーム→→→タンパク質

＜ワキの登場＞

tRNA（運搬）：アミノ酸→→→リボゾーム

＜裏方の登場＞

rRNA（リボゾーム構築）：rRNA＋タンパク質→→→リボゾーム

結局、007はどこにも登場しませんでしたが、そうすると主役は誰なのでしょうか？タンパク質の生成にかかわるのが、mRNA（メッセンジャー）ですからmRNAだと思うのですが、メッセンジャーが主役とはどうもすっきりしないドラマですね。

しかし、ちょっと待って下さい。テーマは転写です。タンパク質の生成はもっと後の場面ですね。この場面に限っていうなら転写の主役はRNAポリメラーゼなのではないでしょうか？

RNAポリメラーゼなどという役者が突然現れましたが、RNAポリメラーゼって一体何者なのでしょうか?

いつでも思うのですが、遺伝子の仕組みはいつでもどこでも、巧妙にできています。ドラマで喩えられるように予定調和しているのですね。私達の人生が予定調和しないのとは随分違います。これが低いレベルモナドだとはとても思えません。普通のドラマには原作者や脚本家がいます。ですから予定調和させられるのですね。

遺伝子の仕組みには原作者や脚本家はいません。それなのにどうして、こうも上手く出来ているのでしょうね。RNAポリメラーゼという役割を持ったシテが現れるというのも不思議です。5W1Hなどをどうして分かるのでしょうね。

RNAポリメラーゼというのは酵素なのですね。又もや酵素です。酵素というのはイデアのエージェントではないかと睨んでいるのですが、予定調和を説明するにはエージェントでは役不足ですよね。やはり原作者や脚本家がいないと話が合いません。RNAの種類によって使われるRNAポリメラーゼの種類も違うのですからね。一体誰がそれを決めているのでしょうね。　使う酵素が違うから転写の仕方も少し違うようですね。しかし、基本的には同じで、5'から3'の方向に転写されるようです。不思議の連発ですが、先を急ぎましょう。

RNAとRNAポリメラーゼの三角錐は次の通りです。

RNAポリメラーゼ１：DNA→rRNA
RNAポリメラーゼ2：DNA→mRNA
RNAポリメラーゼ3：DNA→tRNA

転写の詳細な述語過程（記号過程）は神秘的ですが神秘的と言っていたのでは先に進めませんので、更に、詳細を見ていきましょう。先ず、突然、RNAポリメラーゼが登場します。いつ、どこからは今の所不明です。RNAポリメラーゼはDNAに侵入して、２重螺旋をほどいてしまいます。そこから片方の鎖を鋳型として5'から3'の方向に転写が始めるのです。RNAポリメラーゼは塩基対の組み合わせを利用して、もう片方の鎖のコピーを作るのですね。しかしそのコピーでは、すべてのＴがＵに置き換えられるのですね。

転写の詳細な述語過程を見ていきましょう。

続く